乙文支德還渾然不知發生了如此變化。在眼看要不支時，他再度故伎重演，命士兵打起白旗，然後高呼投降。
可這一次，隋軍卻再也不理會了，掛白旗的兩名高麗士兵瞬間就被射成了刺蝟。
而正在攻城的隋軍則繼續進攻，將麵前那些以為隋軍還會退下的高麗人殺得屍橫遍野。
乙文支德不愧為高麗名將，見勢不對，立刻便下令突圍。但他卻沒想到，隋軍早已將四周的城牆圍得水泄不通，高麗軍根本就突不出去。
“從地道走！”乙文支德帶著親兵和自己的家眷從地道逃了出去。
遼東城作為高麗在遼河流域的統治中樞，自然是挖掘了通往城外的地道，以防萬一城破時，主將也有個退路。
不過，乙文支德雖然逃走了，但城中的大部分高麗軍士兵和百姓卻沒法逃走。而隋軍上上下下的將領和士兵，早就恨透了給他們帶來重大犧牲的遼東城。入城之後便進行了大屠殺，全城高麗人，不管男女老少，不管青壯婦孺，全部斬殺。
而無論是楊廣還是宇文述、楊義臣、獨孤羅等，都沒有製止。
因為他們作為多年帶兵的統帥。心中均十分明白，被壓抑太久的隋軍將士們心中需要發泄，如果不讓他們發泄出來，恐怕會對將來的戰爭大大不利。
宇文明的斥候團沒有參加大屠殺，他作為斥候部隊，自然是用不著攻城的，一直在外圍巡弋，以防有高麗的援軍到來。
雖然這個差事聊勝於無，在這樣多的隋軍攻擊麵前，小國寡民的高麗哪還有援軍敢來。但執行這個任務，卻也讓他的部隊免受那種折磨。眼見要破城了，卻被勒令收兵，那種鬱悶可會讓人憋出病來的。
遼東城攻占之後，三路隋軍便進駐了城內，不過城內的屍體太多。雖然三位大將軍已下令盡快掩埋屍體，卻動作有些緩慢，再加上此時已是六月中旬了，天氣炎熱，許多屍體便開始腐爛，發出了陣陣惡臭。
排除了受降使的幹擾之後，其他幾路隋軍也高奏凱歌，攻克了之前久攻不下的城池。
楊廣此時也感到戰事不能久拖了，因為如此多的軍隊和民夫駐紮在此，每天隋軍消耗的糧食都是個天文數字。
於是他決定采取新的作戰計劃。
而這個新作戰計劃，便是在同高麗軍主力在遼東周旋的同時，另派楊義臣和來護兒率一偏師從海上攻打高麗的首都平壤。對高麗實行南北夾擊，以便能在短時間內滅掉高麗。
雖然說是偏師，但也是多達三十多萬人。比高麗全國的軍隊還多三倍。在楊廣看來，不要說攻打平壤，就是順路滅掉新羅和百濟都夠了。
隋軍在南浦登陸之後，高麗的嬰陽王高元派出了少量軍隊與登陸的隋軍進行了試探xing交戰。
而在短暫的交戰之後，高元發現隋軍數量遠高於己，硬拚必然導致慘敗，於是便下令高麗軍假裝被擊敗，並向平壤城裏撤退，準備伏擊隋軍。
楊義臣認為自己立功的大好時機已經來到，於是便親率十萬大軍開始攻擊平壤，而另外的二十萬部隊他則交給了來護兒，讓其向北進攻，以配合楊廣統率的隋軍，一起夾擊在遼東的高麗軍主力。
當楊義臣率軍來到平壤城外的一座衛城時，發現城門大開，城牆上也無人把守。而當他派人進入此衛城後，卻發現地上放著錢財和武器，十分散亂。
楊義臣也是參加過滅陳朝和吐穀渾的老將，自然看得出來，這恐怕是高麗人想伏擊自己軍隊，而搞的把戲。
於是，為了謹慎起見，他便下令禁止士兵爭搶這些東西。
而當隋軍到達衛城內的一座寺廟後，果然遭到了高麗軍的伏擊。
不過高麗用來伏擊的軍隊並不多，在與隋軍交戰一陣後，便不敵，丟下數百具屍體逃之夭夭了。
這一回，連楊義臣也真的以為高麗不行了，認為敵軍的主力早已集中在遼東，平壤一帶十分空虛，已無力與自己的大軍對抗。
於是，他便終於同意了副將的提議，縱兵搶掠衛城內的財物。
不過，楊義臣卻萬萬沒想到，這座衛城內堆滿了引火之物，且大門的千斤閘一旦放下，不用絞盤便無法升起。而絞盤卻早已被高麗軍破壞。
高元見隋軍果然中計，便喝令在城外的高麗軍向城內射入密集的火箭，將早已埋藏好的引火之物全部引燃。
城中頓時火光衝天，濃煙滾滾。楊義臣率領隋軍向城外逃跑，卻發現城門被關閉了無法打開。而當他急中生智，引兵爬上城牆，企圖從城牆放繩索出城時，卻被早已候個正著的高麗軍一箭射死。
隋軍見主將陣亡，加上被困於城中，頓時士氣便崩潰了，如同無頭蒼蠅一樣在城中亂竄。而這時火勢也越來越大，且根本無法撲滅。
到了當天夜裏時，整個衛城已經化為一團火海，火光數十裏外都可看得見。城中的十萬隋軍，除了幾千人僥幸逃出外，其餘的全部被燒死或者在從城牆上爬下時，被高麗軍射死。平壤的威脅完全解除。
而由來護兒率領的二十萬隋軍，在向鴨綠江行進時，卻被從遼東敗退下來，正在後方休整的乙支文德發現了。
乙文支德見這幾天連下暴雨，便當即有了用洪水殲滅隋軍的主意。
他立刻下令在鴨綠江和平壤之間的清川江上遊修築堤壩蓄水。
而當來護兒率領隋軍到達清川江時，見江水很淺，士兵進入水中隻齊腰深。
於是，來護兒便下令隋軍涉水過江。
正當隋朝軍隊過江之時，乙支文德下令開閘放水。正在過河的十餘萬隋軍頓時便被洶湧而來的洪水衝走淹死。
乙支文德隨後便率領高麗軍，向被困於洪水中的隋朝軍隊發動了猛烈的進攻。
由於他準備充分，早備齊了戰船和小舟。在船上的高麗士兵箭如雨下，將還在洪水中掙紮的隋軍士兵一一射死，隻有來護兒僥幸逃脫了。
最後僅有兩千七百名水性較好的士兵，泅水遊過了鴨綠江，返回了大軍之中。
而這時，原本準備展開進攻的隋軍主力也陷入了恐慌之中。因為在遼河東岸的大營中流行起了瘟疫。許多士兵和民夫都病倒了，甚至包括一些駐守的將領。而且瘟疫傳播的速度也很快。而此處是隋軍的糧草輜重存放地，那裏發生了嚴重的瘟疫，將使前線隋軍的進攻不可避免地受到影響。
在這種情況下，楊廣隻得放棄了原來的南北夾擊高麗軍的計劃。
他下令馬上召開會議，將軍中所有高級將領和隨行大臣皆召到大帳之中，商討隋軍下一步的行動方案。
“目前的情況大家都知道了，楊義臣和來護兒這兩個老匹夫辜負了朕對他們的期望，帶領三十萬大軍突襲高麗首都平壤，竟然也能鬧個全軍覆沒。實在是罪該萬死！將朕遠征高麗的大計毀於一旦！”楊廣怒不可遏地大聲吼道。
身為皇帝，竟然也曝了一次粗口，足見他實在是憤怒到了極點。
之前他是想過利用遠征高麗輾除關隴門閥在軍中的勢力，但他卻絕沒有想過要把這場戰爭打輸。如果出動百萬大軍，數百萬民夫，運送了上千萬石糧食，最後還鬧個慘敗收場。這會嚴重動搖他的威信，那些原本就對他有些不服的世家門閥，更會蠢蠢欲動。
裴矩見狀，連忙上前一步，躬身行禮道：“陛下請息怒！眼下雖然我軍失利，但高麗軍也傷亡慘重，據探子回報，乙文支德身邊的兵士也僅有不到三萬人。他們也僅僅隻能固守堅城而已，絕無可能向我軍反攻。眼下其實最主要的，還是如何應付這場在軍營中流行的瘟疫，否則，恐怕過不了半月，我軍大半士兵就會染病死去，屆時高麗軍如再趁火打劫，隻怕……”
他最後一句話雖然沒說，但人人都知道，真若高麗軍在隋軍因瘟疫崩潰之時，掩殺過來，那隋軍即使不鬧個全軍覆沒，恐怕也沒多少人能回得了中原了。
楊廣聽聞之後，也微微色變，於是便轉過頭向虞世基問道：“虞大人，你可問過太醫，這瘟疫能治否？”
虞世基忙擠出一絲難看的笑容道：“回陛下，老臣已問過從後方大營中回來的幾位太醫，他們均對這瘟疫束手無策。雖然首席禦醫劉文峰還未回來，但恐怕他也沒法醫治。而據一位老太醫稱，此病恐怕隻有藥王孫思邈才能醫治……”
